Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF3AQ9Y2N7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms