Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SHOC2Q9UQ13 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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