Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHANK2Q9UPX8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHANK2Q9UPX8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms