Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAF8Q9UPN6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms