Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO5BQ9ULV0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO5BQ9ULV0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms