Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRF3Q9ULT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRF3Q9ULT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms