Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED23Q9ULK4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED23Q9ULK4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms