Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARP4Q9UKK3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP4Q9UKK3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms