Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGA1Q9UJY5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms