Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBE1Q9UJT0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms