Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MBD1Q9UIS9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MBD1Q9UIS9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms