Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHORDC1Q9UHD1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms