Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRPC4Q9UBN4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms