Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPNE7Q9UBL6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms