Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP35Q9P2H5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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