Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms