Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMOD2Q9NZR1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms