Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGEF12Q9NZN5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms