Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EHD3Q9NZN3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms