Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
BICRAQ9NZM4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
BICRAQ9NZM4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms