Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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