Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GINM1Q9NU53 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINM1Q9NU53 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms