Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FZD3Q9NPG1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms