Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSPNQ9HAW4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSPNQ9HAW4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms