Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP44Q9H0E7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms