Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR88Q9GZN0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR88Q9GZN0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR88Q9GZN0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR88Q9GZN0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR88Q9GZN0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR88Q9GZN0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPR88Q9GZN0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms