Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCL11BQ9C0K0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BCL11BQ9C0K0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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