Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL4Q9C0H6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms