Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms