Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
REPIN1Q9BWE0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms