Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NDUFAF3Q9BU61 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NDUFAF3Q9BU61 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NDUFAF3Q9BU61 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NDUFAF3Q9BU61 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NDUFAF3Q9BU61 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NDUFAF3Q9BU61 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NDUFAF3Q9BU61 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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