Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RTKNQ9BST9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms