Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FYCO1Q9BQS8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FYCO1Q9BQS8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms