Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TUBA1CQ9BQE3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms