Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3Q99687 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms