Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAT1Q99536 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAT1Q99536 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms