Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMD1Q99460 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms