Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMG1Q96Q15 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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