Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms