Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YTHDC1Q96MU7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms