Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20AQ96MK3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms