Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP53Q96M91 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms