Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SAMD8Q96LT4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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SAMD8Q96LT4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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SAMD8Q96LT4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
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SAMD8Q96LT4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SAMD8Q96LT4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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SAMD8Q96LT4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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