Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJD4Q96KN9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJD4Q96KN9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms