Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEIL1Q96FI4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms