Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDC3Q96F86 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDC3Q96F86 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms