Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIRT1Q96EB6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms