Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NMD3Q96D46 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms