Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UPRTQ96BW1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms