Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC102AQ96A19 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC102AQ96A19 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms